課程概述 |
本課程擬指導修課同學如何利用現有的(多數可從公開資料庫下載)次世代定序資料,進行大規模的計算分析,旨於從大量的統計數據中獲得具有生物意義的發現,過程中也訓練修課同學如何利用計算方法提升研究效能。
預修課程:生醫資料探勘
這門課假設修課同學:
(1) 熟悉各式各樣的生物資訊資料庫 (如:ncbi, uniprot, genome browser, PDB, TRANSFAC, ...)
(2) 熟悉各種生物序列的處理 (如:sequence alignment, motif finding, ...)
(3) 接觸過NGS data (如:DNA-seq, RNA-seq, ChIP-seq, ...)
(4) 瞭解microarray的運作原理與常用分析 (如:heatmap, differential genes, ...)
(5) 熟悉各種機器學習演算法 (如:clustering, classification, feature selection, ...) |